HE染色：HE染色即蘇木素-伊紅（Hematoxylin-Eosin）染色法，是診斷病理變化的常用染色技術(shù)。這種方法對(duì)任何固定液固定的組織和應(yīng)用各種包埋法的切片均可使用。蘇木素是一種堿性染料，可使組織中的嗜堿性物質(zhì)染成藍(lán)色，如細(xì)胞核中的染色質(zhì)等；伊紅是一種酸性染料，可使組織中的嗜酸性物質(zhì)染成紅色，如多數(shù)細(xì)胞的胞質(zhì)、核仁等在H.E染色的切片中均呈紅色。

MASSON染色：Masson 三色染色又稱馬松染色，是結(jié)締組織染色中最經(jīng)典的一種方法，是膠原纖維染色權(quán)威而經(jīng)典的技術(shù)方法。所謂三色染色通常是指染胞核和能選擇性的顯示膠原纖維和肌纖維。該法染色原理與陰離子染料分子的大小和組織的滲透有關(guān)：分子的大小由分子量來(lái)體現(xiàn)，小分子量易穿透結(jié)構(gòu)致密、滲透性低的組織，而大分子量則只能進(jìn)入結(jié)構(gòu)疏松的、滲透性高的組織。然而，淡綠或苯胺藍(lán)的分子量很大，因此 Masson 染色后肌纖維呈紅色， 膠原纖維呈綠色或藍(lán)色，主要用于區(qū)分膠原纖維和肌纖維。膠原纖維、黏液、軟骨呈藍(lán)色（如亮綠液染色為綠色），胞質(zhì)、肌肉、纖維素、神經(jīng)膠質(zhì)呈紅色，胞核黑藍(lán)色。

PAS糖原染色：PAS染色全稱為過(guò)碘酸雪夫氏染色（schiff periodic acid shiff, PAS），又稱糖原染色。一般用來(lái)顯示糖原和其它多糖物質(zhì)。細(xì)胞胞漿中存在糖原或多糖類物質(zhì)（如糖蛋白、粘多糖、糖脂、粘蛋白等），過(guò)碘酸能使細(xì)胞內(nèi)的多糖乙二醇基氧化為二醛基，其與Schiff試劑中的無(wú)色品紅結(jié)合后呈現(xiàn)紫紅色，沉積在細(xì)胞內(nèi)多糖所在之處。

天狼猩紅染色：天狼星紅染色通常用于組織病理學(xué)中膠原纖維的染色，其染色原理是：天狼星紅染料呈強(qiáng)酸性，易與膠原分子中的堿性基團(tuán)結(jié)合。膠原被染成紅色，肌肉纖維被染成黃色。

甲苯胺藍(lán)染色（TB）：甲苯胺藍(lán)是常用的人工合成染料的一種，屬醌亞胺染料類。含有兩個(gè)發(fā)色團(tuán)和助色團(tuán)使切片上的組織細(xì)胞著色，臨床上常用甲苯胺藍(lán)對(duì)軟骨細(xì)胞和肥大細(xì)胞進(jìn)行染色。

尼氏染色：尼氏染色法(Nissl Staining)是用堿性染料染神經(jīng)組織的一種方法。尼氏體是胞質(zhì)內(nèi)的一種嗜堿性物質(zhì)，廣泛見于各種神經(jīng)元，不同神經(jīng)元中的尼氏體形狀、大小和數(shù)量則各有差異。用于尼氏染色的堿性染料主要有焦油紫、亞甲藍(lán)、甲苯胺藍(lán)和硫堇等。我室主要用焦油紫和硫堇染色。尼氏染色法可以染出尼氏體，用來(lái)觀察神經(jīng)元內(nèi)的細(xì)胞結(jié)構(gòu)；還可以通過(guò)尼氏染色后對(duì)尼氏體的觀察來(lái)了解神經(jīng)元的損傷情況。

油紅O染色：油紅O脂肪染色法是指在日常病理診斷和科研工作中為了顯示組織內(nèi)的脂肪常采用油紅O進(jìn)行染色的方法，油紅O為脂溶性染料，在脂肪內(nèi)能高度溶解，可特異性的使組織內(nèi)甘油三酯等中性脂肪著色。

番紅固綠染色（植物）：固綠是酸性染料，是一種染含有漿質(zhì)的纖維素細(xì)胞組織的染色劑，在染細(xì)胞和植物組織上應(yīng)用極廣。導(dǎo)管可以被番紅染色，篩管可以被固綠染色。番紅-固綠染色液（植物染色）適用于高等植物根、莖、葉的染色。