HE染色：HE染色即蘇木素-伊紅（Hematoxylin-Eosin）染色法，是診斷病理變化的常用染色技術。這種方法對任何固定液固定的組織和應用各種包埋法的切片均可使用。蘇木素是一種堿性染料，可使組織中的嗜堿性物質(zhì)染成藍色，如細胞核中的染色質(zhì)等；伊紅是一種酸性染料，可使組織中的嗜酸性物質(zhì)染成紅色，如多數(shù)細胞的胞質(zhì)、核仁等在H.E染色的切片中均呈紅色。

MASSON染色：Masson 三色染色又稱馬松染色，是結締組織染色中最經(jīng)典的一種方法，是膠原纖維染色權威而經(jīng)典的技術方法。所謂三色染色通常是指染胞核和能選擇性的顯示膠原纖維和肌纖維。該法染色原理與陰離子染料分子的大小和組織的滲透有關：分子的大小由分子量來體現(xiàn)，小分子量易穿透結構致密、滲透性低的組織，而大分子量則只能進入結構疏松的、滲透性高的組織。然而，淡綠或苯胺藍的分子量很大，因此 Masson 染色后肌纖維呈紅色， 膠原纖維呈綠色或藍色，主要用于區(qū)分膠原纖維和肌纖維。膠原纖維、黏液、軟骨呈藍色（如亮綠液染色為綠色），胞質(zhì)、肌肉、纖維素、神經(jīng)膠質(zhì)呈紅色，胞核黑藍色。

PAS糖原染色：PAS染色全稱為過碘酸雪夫氏染色（schiff periodic acid shiff, PAS），又稱糖原染色。一般用來顯示糖原和其它多糖物質(zhì)。細胞胞漿中存在糖原或多糖類物質(zhì)（如糖蛋白、粘多糖、糖脂、粘蛋白等），過碘酸能使細胞內(nèi)的多糖乙二醇基氧化為二醛基，其與Schiff試劑中的無色品紅結合后呈現(xiàn)紫紅色，沉積在細胞內(nèi)多糖所在之處。

天狼猩紅染色：天狼星紅染色通常用于組織病理學中膠原纖維的染色，其染色原理是：天狼星紅染料呈強酸性，易與膠原分子中的堿性基團結合。膠原被染成紅色，肌肉纖維被染成黃色。

甲苯胺藍染色（TB）：甲苯胺藍是常用的人工合成染料的一種，屬醌亞胺染料類。含有兩個發(fā)色團和助色團使切片上的組織細胞著色，臨床上常用甲苯胺藍對軟骨細胞和肥大細胞進行染色。

尼氏染色：尼氏染色法(Nissl Staining)是用堿性染料染神經(jīng)組織的一種方法。尼氏體是胞質(zhì)內(nèi)的一種嗜堿性物質(zhì)，廣泛見于各種神經(jīng)元，不同神經(jīng)元中的尼氏體形狀、大小和數(shù)量則各有差異。用于尼氏染色的堿性染料主要有焦油紫、亞甲藍、甲苯胺藍和硫堇等。我室主要用焦油紫和硫堇染色。尼氏染色法可以染出尼氏體，用來觀察神經(jīng)元內(nèi)的細胞結構；還可以通過尼氏染色后對尼氏體的觀察來了解神經(jīng)元的損傷情況。

油紅O染色：油紅O脂肪染色法是指在日常病理診斷和科研工作中為了顯示組織內(nèi)的脂肪常采用油紅O進行染色的方法，油紅O為脂溶性染料，在脂肪內(nèi)能高度溶解，可特異性的使組織內(nèi)甘油三酯等中性脂肪著色。

番紅固綠染色（植物）：固綠是酸性染料，是一種染含有漿質(zhì)的纖維素細胞組織的染色劑，在染細胞和植物組織上應用極廣。導管可以被番紅染色，篩管可以被固綠染色。番紅-固綠染色液（植物染色）適用于高等植物根、莖、葉的染色。